工程合同仲裁费用是指在工程合同纠纷中进行仲裁所需支付的费用。仲裁是解决工程合同纠纷的一种方式，相比于诉讼，仲裁更加快速、简便、保密。但是，仲裁并不是免费的，仲裁费用则是由仲裁双方或者仲裁机构根据具体情况协商确定的。
根据《中华人民共和国仲裁法》，仲裁费用包括仲裁费、仲裁员费和其他费用。仲裁费是指仲裁机构收取的费用，包括立案费、调解费、仲裁费等。仲裁员费是指仲裁员根据仲裁案件的复杂程度和工作量确定的报酬。其他费用包括开庭费、传票费、律师费等。
在工程合同仲裁中，一般情况下，仲裁费用由双方按比例分担。如果仲裁结果有一方败诉，则败诉方通常需要承担全部或者大部分的仲裁费用。但是在实际操作中，双方也可以根据具体情况协商确定仲裁费用的分担方式。
在选择仲裁机构时，双方可以根据具体情况选择国内仲裁机构或者国际仲裁机构。国内仲裁机构一般包括中国国际经济贸易仲裁委员会、中国国际经济贸易仲裁委员会等；国际仲裁机构包括国际商会国际仲裁院、香港国际仲裁中心等。
在工程合同仲裁费用方面，双方在签订合同时可以约定相关条款，明确仲裁费用的支付方式、分担比例等。如果合同没有明确约定，根据《中华人民共和国仲裁法》规定，仲裁费用应当由申请仲裁的一方预付，然后在仲裁结果中由败诉方承担。
在仲裁过程中，如果双方对仲裁费用的支付有争议，可以通过调解或者申请法院司法支持等方式解决。一般情况下，仲裁费用是不可抗辩的，即使一方提出异议，也需要在仲裁结束后再行处理。
总的来说，工程合同仲裁费用是工程合同纠纷解决过程中的一项非常重要费用，双方在签订合同时应当谨慎约定相关条款，避免产生争议。在仲裁过程中，双方应当遵守相关规定，按照约定支付相应的仲裁费用，保证仲裁过程的正常进行。
